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食品科学与工程专业是在原生物工程的发酵食品工程方向发展起来的工学类本科专业，2009年单独设置专业，2010年正式面向全国招生，现有在校全日制本科学生130名。食品科学与工程专业培养德、智、体、美全面发展，具有较高的思想道德素质、人文素质、业务素质和身心素质；具有较强的创新精神和较高的专业综合能力、拓展能力，以及一定的科研和解决实际问题等专业发展能力；愿意为区域社会经济发展服务的高级应用型专门人才。
该专业现有专业教师14人，其中教授5人、副教授4人；博士6人、硕士4人；该专业有较好的办学条件，拥有食品科学与工程中央与地方共建特色优势学科实验室，和发酵食品生产、果汁生产、面点生产等生产线和学生实训中心；拥有怀化市农产品生产与加工重点实验室，以及特色农产品加工创新性实验点，教学、科研实验用房面积近3000平方米，仪器设备总价值200余万元。
该专业以培养食品行业应用型人才为宗旨，毕业要求具备独立进行传统食品加工工艺设计、现代食品加工工艺设计、加工设备选用、工厂设计、食品生产管理与质量监控、技术经济分析和产品营销等专业发展能力，获得劳动与社会保障部颁发的三级以上公共营养师或食品检验员专业技术证书。
该专业主要课程有食品化学与分析、食品微生物学、食品营养学、食品加工技术原理、食品机械与设备、化工仪表及自动化、食品添加剂、食品贮运学、食品卫生与毒理学、现代食品检验技术、乳与乳制品工艺学、肉灌制品工艺学、蛋制品工艺学、软饮料工艺学、果蔬加工工艺学、发酵制品工艺学、粮油加工工艺学、焙烤制品工艺学、大豆制品工艺学等；实践环节包括课程实验实训、课程见习、生产实习、科技活动、课程设计、专业实习、毕业论文（设计）等。
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